自然科学研究機構 分子科学研究所
理論分子科学研究系分子基礎理論第一研究部門

岡本グループ


研究テーマ

「生体分子構造予測の理論的研究」

計算科学的手法を用いて、蛋白質などの生体分子の立体構造予測に取り組んでいる。特に、拡張アンサンブルに基づくモンテカルロ法(例えば、マルチカノニカル法)などを使って、スーパーコンピューター上のシミュレーションを行っている。これによって、シミュレーションがエネルギー極小状態に留まってしまうという、従来の方法の困難を回避している。計算手法の改良・開発と共に、エネルギー関数(特に溶媒効果)の精度を上げる努力もしている。ランダムコイル状態の初期構造から特異的立体構造への蛋白質の折れたたみを計算機上で再現すると共に、その熱力学的理解を深めることを目指している。


メンバー

      メール(@ims.ac.jp) ホームページ
助教授 岡本 祐幸 (OKAMOTO, Yuko) okamotoy 岡本祐幸のホームページ
助手 奥村 久士 (OKUMURA, Hisashi) hokumura 奥村久士のホームページ
JST PD 川島 雪生 (KAWASHIMA, Yukio) snow 川島雪生のホームページ
NAREGI産学官連携研究員(PD) 小野 ゆり子 (ONO, Yuriko) yuriko 小野ゆり子のホームページ
NAREGI産学官連携研究員 小久保 裕功 (KOKUBO, Hironori) kokubo 小久保裕功のホームページ
総研大生 (D3) 伊藤 暁 (ITO, Satoru) itoh 伊藤暁のホームページ
分子基礎理論第一研究部門秘書 中島 彩 (NAKAJIMA, Hikari) hikari 中島彩のホームページ

元メンバー

IMSフェロー(PD)
(1996年4月 - 1997年10月)
升屋 正人 (MASUYA, Masato)
鹿児島大学
升屋正人のホームページ
助手
(1996年5月 - 1998年2月)
Ulrich H. E. HANSMANN
Michigan Technological University
Ulrich Hansmannのホームページ
総研大生
(1997年4月 - 1999年9月)
大塚 博史 (OHTSUKA, Hiroshi)
学振未来開拓リサーチ・アソーシエイト
(1998年10月 - 2001年3月)
西川 武志 (NISHIKAWA, Takeshi)
産業技術総合研究所
西川武志のホームページ
総研大生,学振未来開拓リサーチ・アソーシエイト
(1996年4月 - 2001年3月)
光武 亜代理 (MITSUTAKE, Ayori)
慶應義塾大学
光武亜代理のホームページ
研究技官
(2000年4月 - 2001年11月)
長島 剛宏 (NAGASIMA, Takehiro)
国立遺伝学研究所
長島剛宏のホームページ
助手
(1998年9月 - 2002年3月)
杉田 有治 (SUGITA, Yuji)
東京大学
杉田有治のホームページ
IMSフェロー(PD),学振未来開拓リサーチ・アソーシエイト
(2000年4月 - 2003年3月)
依田 隆夫 (YODA, Takao)
長浜バイオ大学
依田隆夫のホームページ
学振PD
(2002年4月 - 2003年3月)
野口 博司 (NOGUCHI, Hiroshi)
Institute fuer Festkoerperforschung (IFF), Juelich, Germany
野口博司のホームページ
秘書
(1998年7月 - 2003年3月)
粂 美和子 (KUME, Miwako)
分子研理論研究系秘書室
粂美和子のホームページ
総研大生
(2001年4月 - 2003年9月)
榮 慶丈 (SAKAE, Yoshitake)
広島大学
榮慶丈のホームページ
総研大生
(2001年4月 - 2003年9月)
村田 克美 (MURATA, Katsumi)
京都大学
村田克美のホームページ
IMSフェロー(PD)
(2003年4月 - 2004年3月)
西野 正理 (NISHINO, Masamichi)
物質・材料研究機構
西野正理のホームページ

短期訪問者

分子研客員教授
(2000年5月 - 2000年8月)
Yasuyuki ISHIKAWA
University of Puerto Rico
Ishikawaのホームページ
分子研客員教授
(2002年4月 - 2002年6月)
Bernd A. BERG
Florida State University
Bergのホームページ
学振日伊二国間事業訪問者
(2002年5月)
Giovanni LA PENNA
Consiglio Nazionale delle Ricerche (CNR), Italy
La Pennaのホームページ

所在地

〒444-8585
愛知県岡崎市明大寺町字西郷中38番地
自然科学研究機構 分子科学研究所
南実験棟S413, S416, S417, S309
TEL: 0564-55-7301 (岡本)
  0564-55-7303 (奥村,小野)
  0564-55-7304 (川島,小久保)
  0564-55-7257 (伊藤)
  0564-55-7307 (理論研究系秘書室)
FAX: 0564-53-4660 (理論研究系共通)

・ 理論研究系
・分子科学研究所
・総合研究大学院大学数物科学研究科
・自然科学研究機構

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記載責任者: 岡本 祐幸(okamotoy@ims.ac.jp)


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